L'istituzione è avvenuta con la deliberazione della Giunta Regionale 13 febbraio 2023, n. 183, pubblicata sul bollettino ufficiale n. 54 del 01/03/23.
Il Sistema dà seguito alla previsione normativa, il D.L. 36/2022, che ha istituito il Sistema nazionale prevenzione salute dai rischi ambientali e climatici (SNPS) «allo scopo di migliorare e armonizzare le politiche e le strategie messe in atto dal Servizio sanitario nazionale per la prevenzione, il controllo e la cura delle malattie acute e croniche, trasmissibili e non trasmissibili, associate a rischi ambientali e climatici», e attua il D.M. 9 giugno 2022 (si ricorda, infatti, che il SNPS fa parte degli interventi finanziati con il Piano nazionale per gli investimenti complementari al PNRR).
Il suo compito primario è, quindi, quello di assicurare il coordinamento e il potenziamento dell'integrazione delle attività delle strutture del territorio che operano a tutela della salute collettiva, rispetto ai rischi ambientali e climatici.